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Las superficies modificadas con metales como Ag y Cu están siendo estudiadas como un material eficaz para reducir el riesgo de enfermedades provocadas por virus y bacterias [1]. En este trabajo se llevó a cabo la desinfección de agua de perforación contaminada con Escherichia coli (E. coli) mediante la liberación de especies de cobre en una celda de flujo con caudal variable. Previamente se reportó que la electrosíntesis de polipirrol (PPy) bajo condiciones potenciotásticas y en presencia de altas concentraciones de salicilato de sodio (NaSa) conduce a la formación de microtubos rectangulares huecos sobre Acero Inoxidable 316L (AI 316L)[2, 3]. En esta matriz microestructurada se inmovilizaron especies de Cu a través de su inmersión en una solución 0.10 M CuSO4.5H2O + 0.10 M NaSO4 de pH 1 durante 24 h y bajo condiciones de potencial de circuito abierto (PCA)[4]. Posteriormente los electrodos recubiertos fueron colocados en la celda y se estudió el efecto de la velocidad de flujo sobre la remoción de bacterias durante 5 h de experiencia. Se trabajó dentro de un régimen de flujo laminar y con tres condiciones de número de Reynolds (Re) diferentes. Los resultados demostraron que la velocidad de remoción de bacterias aumenta con el incremento del número Re, siendo la condición con mayor Re la que permite remover la totalidad de bacterias luego de 2 h. La observación mediante microscopía electrónica de barrido (MEB) de la superficie de los recubrimientos mostró que la microestructura se conserva luego de 5 h de experiencia.